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外显子组(exomes)是基因组中全部外显子的总和。以人类基因组为例,共计约 18 万个外显子,仅占基因组总量的 1%,碱基规模约 30Mbp。针对全部外显子区域开展测序的技术,即为全外显子组测序,简称 WES。人类外显子组占基因组比例不足 2%,却囊括了约 85% 的疾病相关变异,因此在编码区基因变异研究中,该技术相较全基因组测序,具备更高的经济性与检测效率。


技术原理

WES基于目标捕获测序(Targeted Capture Sequencing)原理。首先通过超声打断或酶切将基因组DNA片段化,然后利用与所有已知外显子区域互补的生物素标记探针(Bait/Probe)与片段化DNA进行液相杂交,特异性地"钓取"外显子片段;随后通过磁珠分离捕获的目标片段,经过PCR扩增和文库构建后,在高通量测序平台上进行双端测序(Paired-End),最终通过生物信息学分析识别SNV(单核苷酸变异)、Indel(插入缺失)、CNV(拷贝数变异)等变异类型。

技术优势

  1. 高性价比:相比全基因组测序(WGS),WES仅测序1%的基因组,数据量小、成本低,通常价格仅为WGS的1/5-1/10
  2. 高深度覆盖:可将测序深度提升至100X-200X甚至更高,有效提升低频突变和杂合突变的检测灵敏度
  3. 聚焦功能区域:直接针对编码区,避免非编码区大量未知变异的干扰,临床解读更明确
  4. 检测全面:可同步检测SNV、Indel及部分CNV,覆盖已知约20,000个基因的外显子区域
  5. 数据存储友好:单样本原始数据约10-20GB,远低于WGS的90GB+,便于大规模存储和传输

应用领域

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领域具体应用
罕见病诊断儿童发育迟缓、智力障碍、多发畸形等未确诊遗传病的分子诊断,诊断率可达25%-40%
肿瘤精准医疗实体瘤/血液肿瘤的体细胞突变检测、靶向用药指导(如EGFR、KRAS等用药相关突变)、耐药监测
遗传病携带者筛查隐性遗传病(如地中海贫血、脊髓性肌萎缩症)的孕前/产前携带者筛查
药物基因组学药物代谢酶(如CYP450家族)和药物靶点基因变异检测,指导个体化用药
科研转化新致病基因发现、队列研究、多组学整合分析

关键质控节点:

DNA完整性、文库片段分布、捕获效率(中靶率>60%)、覆盖均一性、测序深度(有效深度>100X)、碱基质量(Q30>85%)。

送样建议:

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组织类型送样建议
冻存组织大于 0.1 g
培养细胞数量>5×10⁶ 个
全血>1 ml
FFPE厚度 5-10 μm,含组织面积大于 25 mm² 的切片 6 张
DNA总量 >500 ng
血浆/血清>3 ml