外显子组(exomes)是基因组中全部外显子的总和。以人类基因组为例,共计约 18 万个外显子,仅占基因组总量的 1%,碱基规模约 30Mbp。针对全部外显子区域开展测序的技术,即为全外显子组测序,简称 WES。人类外显子组占基因组比例不足 2%,却囊括了约 85% 的疾病相关变异,因此在编码区基因变异研究中,该技术相较全基因组测序,具备更高的经济性与检测效率。
WES基于目标捕获测序(Targeted Capture Sequencing)原理。首先通过超声打断或酶切将基因组DNA片段化,然后利用与所有已知外显子区域互补的生物素标记探针(Bait/Probe)与片段化DNA进行液相杂交,特异性地"钓取"外显子片段;随后通过磁珠分离捕获的目标片段,经过PCR扩增和文库构建后,在高通量测序平台上进行双端测序(Paired-End),最终通过生物信息学分析识别SNV(单核苷酸变异)、Indel(插入缺失)、CNV(拷贝数变异)等变异类型。
| 领域 | 具体应用 |
|---|---|
| 罕见病诊断 | 儿童发育迟缓、智力障碍、多发畸形等未确诊遗传病的分子诊断,诊断率可达25%-40% |
| 肿瘤精准医疗 | 实体瘤/血液肿瘤的体细胞突变检测、靶向用药指导(如EGFR、KRAS等用药相关突变)、耐药监测 |
| 遗传病携带者筛查 | 隐性遗传病(如地中海贫血、脊髓性肌萎缩症)的孕前/产前携带者筛查 |
| 药物基因组学 | 药物代谢酶(如CYP450家族)和药物靶点基因变异检测,指导个体化用药 |
| 科研转化 | 新致病基因发现、队列研究、多组学整合分析 |
DNA完整性、文库片段分布、捕获效率(中靶率>60%)、覆盖均一性、测序深度(有效深度>100X)、碱基质量(Q30>85%)。
| 组织类型 | 送样建议 |
|---|---|
| 冻存组织 | 大于 0.1 g |
| 培养细胞数量 | >5×10⁶ 个 |
| 全血 | >1 ml |
| FFPE | 厚度 5-10 μm,含组织面积大于 25 mm² 的切片 6 张 |
| DNA | 总量 >500 ng |
| 血浆/血清 | >3 ml |
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